双侧输卵管通而不畅最常见的原因是输卵管炎症或盆腔腹膜炎症所致。

炎症可以使输卵管粘膜破坏而形成瘢痕，引起管腔狭窄或阻塞。其中结核菌的感染是一个主要的病因，而人工流产后引起急性盆腔炎、输卵管炎也是屡见不鲜的。子宫内膜异位在输卵管会引起双侧输卵管不通。

输卵管病变也是导致双侧输卵管通而不畅的原因之一。输卵管炎的病因是由于病原体感染引起，病原体主要有葡萄球菌、链球菌、大肠杆菌、淋球菌、变形杆菌、肺炎球菌、衣原体等所引起，这种炎症往往是一次性且短暂的，但由于感染性炎症所引起的双侧输卵管通而不畅将是永久性的，不可治愈的。